Identificazione e validazione di marcatori molecolari, fisiologici ed ambientali per la gestione delle risorse alieutiche lagunari

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dc.contributor.advisor Argese, Emanuele it_IT
dc.contributor.author Baccarani, Gianluca <1983> it_IT
dc.date.accessioned 2012-11-27T11:01:52Z
dc.date.available 2012-11-27T11:01:52Z
dc.date.issued 2012-09-14 it_IT
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10579/1255
dc.description.abstract La vongola filippina Ruditapes philippinarum rappresenta una delle principali risorse economiche per l’acquacoltura nel Nord Adriatico. Molte criticità di gestione rimangono irrisolte, specialmente nella Laguna di Venezia: pesca illegale, rischi per la salute, overfishing. Qualità e integrità ambientale dei siti di allevamento sono dunque aspetti di indagine fondamentali. Il presente progetto si inserisce nell’ambito di un approccio integrato per la gestione della risorsa e la specifica messa a punto di un percorso di tracciabilità di filiera. È stato analizzato il contenuto di metalli pesanti e la loro biodisponibilità nei sedimenti; sono state condotte analisi di bioaccumulo e quantificato il contenuto di metallotioneine negli organismi; è stata valutata la diversità genetica delle popolazioni tramite l’utilizzo di marcatori del DNA nucleare e mitocondriale. Sulla base dei risultati ottenuti dalle analisi chimiche è possibile esprimere un giudizio positivo sullo stato di salute delle aree indagate, anche se la gestione dei siti può essere migliorata in un’ottica di sostenibilità e mitigazione degli impatti; le analisi genetiche hanno mostrato un chiaro differenziamento biogeografico degli aplotipi e il verificarsi di eventi introduttivi multipli. La presente ricerca presenta notevoli prospettive future, sia in termini di conoscenza di base, sia in termini applicativi. it_IT
dc.description.abstract Manila clam Ruditapes philippinarum represents one of the main economic resources for Northern Adriatic aquaculture. Many management issues are still unsolved, especially in the Venice Lagoon: illegal fishing, health risks, overfishing. Hence, the evaluation of quality and integrity of production sites is a very important topic. The present work is part of an integrated and multidisciplinar approach aimed at improving the management of the resource and also developing a specific traceability path. Heavy metals content both in sediments and organisms was determined; also, metallothioneins levels were evaluated. Finally, the level of genetic diversity among populations was assessed, through specific molecular markers. Results showed that, in general, the environmental quality of farming sites could be considered as quite good, although management of clam farming shoud be improved for a sustainable exploitation of the resource and for a mitigation of impacts. Genetic analysis showed a clear geographic structuring of haplotypes and the occurrence of multiple introduction events from different recruitment stocks. The present project presents interesting future perspectives, both in terms of basic knowledge and application. it_IT
dc.format.medium Tesi cartacea it_IT
dc.language.iso it it_IT
dc.publisher Università Ca' Foscari Venezia it_IT
dc.rights © Gianluca Baccarani, 2012 it_IT
dc.subject Ruditapes philippinarum it_IT
dc.subject Biomarkers it_IT
dc.subject Bioaccumulo it_IT
dc.subject Sedimento it_IT
dc.subject Speciazione it_IT
dc.subject DNA barcoding it_IT
dc.subject Loci microsatelliti it_IT
dc.title Identificazione e validazione di marcatori molecolari, fisiologici ed ambientali per la gestione delle risorse alieutiche lagunari it_IT
dc.type Doctoral Thesis it_IT
dc.degree.name Scienze ambientali it_IT
dc.degree.level Dottorato di ricerca it_IT
dc.degree.grantor Scuola di dottorato in Scienze e tecnologie (SDST) it_IT
dc.description.academicyear 2010/2011 it_IT
dc.description.cycle 24 it_IT
dc.degree.coordinator Pavoni, Bruno it_IT
dc.location.shelfmark D001185 it_IT
dc.location Venezia, Archivio Università Ca' Foscari, Tesi Dottorato it_IT
dc.rights.accessrights openAccess it_IT
dc.thesis.matricno 955658 it_IT
dc.format.pagenumber III, 224 p. : ill. it_IT
dc.subject.miur BIO/07 ECOLOGIA it_IT
dc.description.tableofcontent 1. Introduzione 1 1.1 Lo Stato dell’Arte della Venericoltura nel Nord Est 1 1.2 Biologia ed Ecologia di R. philippinarum come organismo modello 6 1.3 Aree idonee all’Allevamento: caratteristiche di base 11 1.4 Potenziali cause dell’Inquinamento Inorganico 14 1.4.1 Laguna di Venezia 14 1.4.2 Delta del Po 17 1.5 Distribuzione dei metalli nei sedimenti: biodisponibilità, bioaccessibilità, bioaccumulo 19 1.6 Bioindicatori in Ambienti di Transizione 26 1.6.1 Metallotioneine 29 1.7 Genetica molecolare e tracciabilità della filiera 33 1.8 Obiettivi e scopo del lavoro 38 2. Aree di Studio 39 2.1. Definizione e caratterizzazione delle Stazioni in Laguna di Venezia 39 2.2 Definizione e caratterizzazione delle Stazioni sul Delta del Po 44 3. Materiali e Metodi 49 3.1 Raccolta dei campioni 49 3.2 Materiali e reagenti 53 3.3 Estrazione dei metalli in campioni di sedimento ed organismi mediante digestore a microonde 54 3.4 Analisi sui sedimenti 57 3.4.1 Indagine granulometrica 57 3.4.2 Contenuto totale di metalli 58 3.4.3 Speciazione geochimica 60 3.5 Analisi sugli organismi 65 3.5.1 Contenuto totale di metalli 65 3.5.2 Quantificazione delle metallotioneine 65 3.5.3 Fattore di bioaccumulo (BAF) 69 3.5.4 Condition Index (CI) 69 3.6 Metodi analitici utilizzati per l’analisi dei metalli nei campioni di sedimento e organismi 72 3.7 Controllo e ottimizzazione della performance delle procedure di estrazione e delle analisi strumentali dei metalli pesanti e metalloidi testati 76 3.8. Analisi statistiche sui dati ambientali 78 3.9 Analisi genetiche 79 3.9.1 Estrazione e purificazione del DNA genomico. 80 3.9.2. Amplificazione tramite PCR 82 3.9.3. Analisi di sequenziamento diretto del gene mitocondriale 16S 82 3.9.4. Analisi di loci microsatelliti 83 3.9.5. Analisi statistiche e filogenetiche dei dati di genetica molecolare 84 4. Risultati e Discussione 87 4.1 Indagine granulometrica 88 4.2 Contenuto totale di metalli nei sedimenti 91 4.3 Contenuto di metalli negli organismi 101 4.4 Speciazione geochimica 119 Arsenico 119 Cromo 124 Nichel 128 Rame 132 Zinco 136 Cadmio 140 Piombo 144 Ferro 148 Mercurio 152 4.5 Fattore di bioaccumulo 153 4.6 Metallotioneine 155 4.7 Condition Index (CI) 160 4.9 Analisi Genetiche 163 4.9.1. Estrazione e purificazione del DNA genomico 163 4.9.2. Analisi del gene mitocondriale 16S 163 4.9.3. Analisi di loci microsatelliti 175 5. Conclusioni 193 6. Bibliografia 201 6.1 Siti Internet di interesse 220 7. Produzione Scientifica del Candidato 221 7.1 Partecipazione a Congressi Internazionali 221 7.2 Partecipazione a Congressi Nazionali 221 7.3 Abstract brevi 221 7.4 Extended abstracts 222 7.5 Pubblicazioni originali su riviste con I.F. 222 Ringraziamenti 223 Estratto per riassunto della tesi di dottorato 225 it_IT
dc.identifier.bibliographiccitation Baccarani G. "Identificazione e validazione di marcatori molecolari, fisiologici ed ambientali per la gestione delle risorse alieutiche lagunari", Università Ca' Foscari Venezia, tesi di dottorato, XXIV ciclo, 2012. it_IT


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